> Я всегда думал, что InnoDB надо использовать, когда много инсертов в таблицу. В случае логов - именно так и есть, но Вы говорите, что использовали бы MyISAM. Что я не так понял?

Глупости. Если одна-единственная программа работает с базой данных то MyISAM лучше.
А вот когда множество подключения различных приложений, то тут нужно смотреть. Прежде всего как много делается чтений и записей.

Дело в том что MyISAM блокирует таблицу целиком. Если чтений не много то это не страшно.